报告题目:结合两篇Nature Genetics文章解析高通量测序在基因组学和功能基因组学中的具体应用
报 告人:许语辉、周剑南
报告时间:2016年9月28日上午, 9:00-11:00
报告地点:南校区科研主楼2302会议室
报告内容:
1.基因组学和功能基因组学
截止到2016年9月,百迈客研究院成立七年,凭借专业领先的实验技术和强大的生物信息分析团队,百迈客研究院及合作伙伴共发表高通量测序文献300+篇,影响因子总计1000+。2016年实现Nature Genetics两连发。本次报告旨在结合百迈客研究院及其合作伙伴发表的高水平文章,阐明高通量测序在基因组学和功能基因组学中的具体应用,基因组、遗传进化、基因定位、转录调控等研究思路;探讨科学研究中材料选取、方案设计和信息分析等难题,为您的科研事业助力。
2.基于高通量测序技术,在基因组和功能基因组研究中的应用实例分析:
群体进化案例:Subgenome parallel selection is associated with morphotype diversification and convergent crop domestication in Brassica rapa and Brassica oleracea. (芸薹属)
基因组学案例:The genome sequence of allopolyploid Brassica juncea and analysis of differential homoeolog gene expression influencing selection.(芥菜)
转录组案例1:Transcriptome analysis of Chlorella zofingiensis to identify genes and their expressions involved in astaxanthin and triacylglycerol biosynthesis(小球藻)
转录组案例2:The circadian clock regulates autophagy directly through the nuclear hormone receptor Nr1d1/Rev-erbα and indirectly via Cebpb/(C/ebpβ) in zebrafish(斑马鱼)
lncRNA案例:Genome-wide identification and functional prediction of novel and fungi-esponsive lincRNAs in Triticum aestivum(小麦)
miRNA案例:Phylogenetic tree-informed microRNAome analysis uncovers conserved and lineage-specific miRNAs in Camellia during floral organ development(山茶花)
circRNA案例:Deciphering the roles of circRNAs on chilling injury in tomato(番茄)
报告人简介:
许语辉 中国农业大学作物遗传育种博士,现任百迈客群体研究部资深产品经理。博士期间参与国家“948”计划水稻重要抗旱种质资源筛选以及抗旱功能基因定位研究,欧盟第六框架计划项目和校企合作稻作品种联合开发项目。在百迈客负责遗传图谱和BSA产品,组织参与甜瓜高密度遗传图谱和抗性基因定位项目,与中科院遗传所和动物所等相关科研单位对作物、水产、林木和哺乳动物等物种的高密度遗传图谱构建策略展开设计,项目经验丰富。
周剑南 新加坡国立大学植物遗传学博士,现任百迈客转录调控事业部资深产品经理。在百迈客负责转录调控相关产品,内容涵盖RNA-seq、lncRNA-seq、circRNA-seq、small RNA-seq、三代全长转录组和甲基化等。与中科院遗传所和动物所等相关科研单位对作物、昆虫、林木和微生物等物种的转录调控研究展开实验方案设计,项目经验丰富。
旱区作物逆境生物学国家重点实验室
2016年9月23